快速公交3号线的通车，本是为了给居民提供舒适快捷的出行条件，但不少居民对于其专用车道提出了“资源浪费”的质疑。2009年7月29日，北京公交集团工作人员表示，普通公交将驶入快速公交3号线专用车道。

　　记者在地铁天通苑站附近看到，两条用隔离栏“围”起来的快速公交3号线专用车道，占据了整个马路近三分之一的路面。相比在普通公交站牌前候车的众多乘客，等候乘坐快速3号线的乘客屈指可数。

　　记者在快速公交3号线沿线采访了几位在普通公交站台候车的乘客。有乘客表示：“快速公交的站台是单独封闭的，进站麻烦，有时候老半天不来一辆。”家住天通苑的乘客马女士说，自己一般都会坐普通公交，“快3线到的地方，许多路公交也能到，选择很多，上哪趟车都行。”

　　“从立水桥到平西府车流量本来就挺大，许多住在顺义的居民为了换乘13号线也走这条路，自从去年快速公交3号线通了之后，这里堵车的现象就更严重了，尤其是在上下班时。”出租车司机韩先生表示，有时候早晨实在太堵，会有胆子比较大的私家车主直接冒险走快速公交车道。

　　公交车司机刘先生说，从立水桥到平西府有数十条公交线路，与私家车拥挤行驶在道上，而“3号线乘客流量不大，班次也不多，却有一条专用车道，现在经常出现旁边的道路堵得非常严重、快速车道却空荡荡的情况，这样太浪费资源。”

　　北京公交集团第一客运分公司相关部门负责人表示，上述问题并非仅仅存在于快速公交3号线，他向记者透露，普通公交将驶入快速公交3号线专用车道，具体的公交路线及调整日期上级部门正在制订中。